Используют шишкоягоды. Применяется в виде мочегонного средства при хронических (неострых) воспалениях почек и мочевого пузыря, при суставных болях, дерматитах и при заболеваниях желудка и печени. При воспалении почек принимать осторожно. Применять настой из 2 чайных ложек сухих, измельченных плодов, залитых стаканом воды и выдержанных в течение 3 часов (суточная доза) — как мочегонное средство. 100 г плодов варят с 400 г воды, процеживают и варят на водяной бане с сахаром для получения сиропа; принимают этот сироп 3 раза в день по чайной ложке перед едой при заболеваниях желудка. Отвар из плодов используют для ванн при лечении ревматизма: 200 г ягод варят с 1 л воды и этот отвар прибавляют к воде для ванны.
При кожных сыпях весной применяют плоды можжевельника, съедая по несколько штук в день (в первый день - 5, на второй —
6 и т.д., до 15 плодиков в день, затем уменьшают снова постепенно до 5 плодиков в день.